黑龙江省能源环境研究院始终坚持以国家和黑龙江省战略需求为导向，近年来形成了能源化学、生物能源和环境与污染防控三个学科领域六个重点科研方向的科学研究体系。建成了首座可全年连续稳定运行的大型沼气发电工程并率先打造生物能源分布式供能模式，实现技术与产业双引领；石油基、生物基新材料形成技术突破，赋能传统产业提质升级；煤矸石、石墨尾矿、农业有机固废等综合利用领域形成技术创新，填补空白；省能环院积极打造“清洁能源”品牌，实现技术引领，助力产业经济发展。

研究院拥有能源化学省级领军人才梯队和省科学院生物能源利用创新团队，建有智慧低碳能源头雁团队工作站，拥有省级高层次人才D类1人。

研究院建有黑龙江省燃油燃煤清洁能源重点实验室和黑龙江省科学院生物能源工程技术研究中心，是黑龙江生物质成型燃料锅炉产业技术创新联盟、生物燃气高值化利用与装备产业技术研究院和生物能源智能装备产业技术研究院的建设单位，是省能源环境学会的挂靠单位。

建院以来，累计完成国家科技攻关项目4项，科技部国际科技合作项目1项，黑龙江省科技重大项目1项，黑龙江省科技攻关项目11项，省自然科学基金2项，各级科研项目120余项，在研省级项目7项，获得省科技进步一等奖1项，省科技发明一等奖2项，省科技进步二等奖3项，中国石油和化学协会科技进步二等奖1项，省科技进步三等奖1项，省科学院科技进步一等奖2项、二等奖1项；获得国家专利100余项；发表科技论文200余篇。